Modélisation et identification de QTLs de l’architecture et de la production de biomasse chez six espèces de caféiers africains

Abstract

La production de café de la Côte d’Ivoire a baissé de 2/3, passant de 300000 tonnes dans les années 1970 à 100000 tonnes en ce moment. Ainsi, le pays a engagé comme priorité, la relance de la caféiculture. Cette relance demande la création de nouveaux idéotypes de caféiers hauts producteurs et adaptés aux nouveaux défis climatiques et environnementaux. A cet effet, la prise en compte de l’architecture s’est imposée, car de modélisation de son architecturales sont des indicateurs de productivité chez le caféier. Cette étude a donc été menée pour contribuer à l’amélioration de la productivité du caféier par la modélisation de son architecture. Pour ce faire, le modèle structure-fonction GreenLab a été utilisé pour analyser, par une méthode non destructive, les paramètres de développement et de croissance de six espèces de caféiers d’origine africaine : Coffea canephora, C. liberica var. liberica, C. liberica var. dewevrei, c. stenophylla, c. pseudozanguebariae et c. racemosa. Par ailleurs, le déterminisme génétique des caractères architecturaux a été recherché via une population backcross de Coffea canephora, en utilisant la méthode Genotyping-By-Sequencing (GBS). Les résultats ont montré que les paramètres de développement que sont les probabilités de développement du tronc, de ramification, de développement des branches et le rapport de rythme ne diffèrent pas entre les espèces. Ces paramètres permettent de simuler la structure topologique de ces espèces. Concernant la croissance, une variabilité interspécifique a été mise en évidence. Ainsi, les paramètres de fonctionnement tels que, les puits des organes, la surface de production et la résistance des feuilles à la transpiration, varient d’une espèce à l’autre montrant que chacune d’elles a son propre.